베를린으로 돌아와 청소년교육사업에 힘쓰던 베셀은 노동자세력을 포섭하기 위한 활동에 매진하게 되고 그로인해 공산당의 폭력기구인 붉은전사연맹의 살생부에 오르고 만다. 그당시 베셀은 헌신과 애정으로 매춘굴에서 구해낸 애인 에르나 예니헨과 그로세 프랑크푸르트 거리에 있는 허름한 집에서 동거중이었다.
1월 14일, 베셀과 밀린 월세로 실랑이를 벌였던 집주인 잘름은 사별한 공산당 남편의 동지들에게 베셀의 위치를 밀고한다. 베셀의 위치를 파악한 알베르트 횔러와 에르빈 뤼케르트 등 공산당 폭도들이 베셀의 방에 난입하여 애인이 보는 앞에서 얼굴에 권총을 난사해 중상을 입힌다.
베셀이 입원한 후 이 사건은 공산당과 나찌당의 사활을 건 선전전으로 비화된다.
공산당은 사건 다음날 카를 리프크네히트 회관으로 잘름을 불러내 이 사건을 매춘부시비로 발생한 포주들간의 분쟁이라고 경찰에 진술할 것을 강요하였고, 베를린 관구장 요제프 괴벨스를 중심으로 한 나찌당은 이는 우발적인 사건이 아닌 정치테러이며 사전계획된 고의적인 범죄라며 이에 맞섰다.
결국 베셀은 회복하지 못한채 약 한달전 사고로 사망한 동생 베르너 베셀의 뒤를 이어 다음달 23일 사망한다. (동생도 돌격대원이었다)이후 사건은 경찰수사 결과 공산당의 계획된 범죄로 확인되었다.
3월 1일 베셀의 장례식이 열린 날에도 공산당은 경찰의 저지선을 무시하며 난동을 부렸다. 폭도들은 인터내셔널가를 부르며 돌을 던지고 총을 쏘며 운구행렬을 방해하였으며 죽은 베셀을 포주라 조롱하며 끝까지 고인을 욕되게 하였다.
장례식은 베를린의 성 니콜라이 묘지에서 열렸으며, 요제프 괴벨스의 주관하에 헤르만 괴링, 돌격대장 프란츠 폰 페퍼, 전 독일황제 빌헬름2세의 아들 아우구스트 빌헬름 왕자 등 베를린의 나찌주요인사들이 참석하였고, 나찌당원과 돌격대 대원들에 의해 엄숙히 치뤄졌다.
장례식장에서 처음 불려진 <호르스트 베셀의 노래>는 이후 <독일인의 노래>와 함께 제3제국의 국가가 되었다.
추모기간이 끝난 후 같은 해 살인범 알베르트 횔러는 돌격대에 의해 사살되었다.